Sukladno Zakonu o ustanovama i Zakonu o hrvatskim braniteljima iz Domovinskog rata i članovima njihovih obitelji Veteranskim centrom upravlja Upravno vijeće. Članove Upravnog vijeća imenuje Ministarstvo hrvatskih branitelja. Rješenjem o osnivanju Veteranskog centra je određeno da se u Upravno vijeće imenuju:
- dva predstavnika Ministarstva
- predstavnik tijela državne uprave nadležnog za zdravstvo
- predstavnik tijela državne uprave nadležnog za unutarnje poslove
- predstavnik tijela državne uprave nadležnog za obranu
- predstavnik tijela državne uprave nadležnog za regionalni razvoj i fondove Europske unije
- predstavnik Odbora za ratne veterane Hrvatskog sabora
- predstavnik Grada Daruvara
- predstavnik Grada Petrinje
- predstavnik Grada Sinja
- predstavnik Grada Šibenika
- predstavnik udruga iz Domovinskog rata s područja Daruvara
- predstavnik udruga iz Domovinskog rata s područja Petrinje
- predstavnik udruga iz Domovinskog rata s područja Sinja
- predstavnik udruga iz Domovinskog rata s područja Šibenika
Predsjednik i zamjenik predsjednika upravnog vijeća imenuju se između članova Upravnog vijeća koji su predstavnici Ministarstva.
Prema Statutu Veteranskog centra Upravno vijeće obavlja sljedeće poslove:
- donosi Pravilnik o unutarnjem ustrojstvu i sistematizaciji radnih mjesta
- donosi Pravilnik o radu
- donosi Pravilnik o odgovornosti radnika za povrede obveza iz radnog odnosa
- donosi Pravilnik o zaštiti na radu
- donosi Pravilnik o zaštiti od požara
- donosi Pravilnik o postupcima nabave na koji se ne primjenjuje Zakon o javnoj nabavi
- donosi Pravilnik o upotrebi i čuvanju pečata i štambilja
- donosi Pravilnik o čuvanju, korištenju, odabiranju i izlučivanju arhivske i registraturne građe
- donosi Pravilnik o poslovnoj i profesionalnoj tajni
- donosi Naputak o uredskom poslovanju
- donosi Plan brojčanih oznaka
- donosi Plan nabave
- donosi Poslovnik o radu Upravnog vijeća
- donosi Godišnji plan rada Ustanove
- donosi Stručni program Ustanove
- donosi Pravilnik o uvjetima i načinu ostvarivanja prava na korištenje usluga Ustanove
- donosi odluku o imenovanju i razrješenju ravnatelja i zamjenika ravnatelja i sklapa s njim ugovor o radu na određeno vrijeme za mandatno razdoblje
- donosi odluku o imenovanju i razrješenju stručnog voditelja i voditelja podružnice i sklapa s njima ugovor o radu na određeno vrijeme za mandatno razdoblje
- analizira financijsko poslovanje Ustanove najmanje svakih šest mjeseca i usvaja izvještaje ravnatelja o izvršenju Financijskog plana
- daje Ministarstvu i ravnatelju prijedloge i mišljenja o pitanjima važnim za rad Ustanove i
- donosi odluke, zaključke i druge akte potrebne za rad Ustanove.
Pored prethodno navedenih poslova, Upravno vijeće razmatra stanje i rezultate rada Ustanove, prati organiziranje i izvršavanje djelatnosti u Ustanovi te u svezi s time poduzima potrebne mjere, prati materijalne potrebe Ustanove te surađuje s državnim tijelima, drugim ustanovama i udrugama.
Članovi upravnog vijeća:
- Tomo Medved, predstavnik Ministarstva hrvatskih branitelja, predsjednik
- Nevenka Benić, predstavnica Ministarstva hrvatskih branitelja, zamjenica predsjednika
- Zdravko Batarilo, predstavnik Ministarstva zdravstva, član
- Gordana Bušić-Vojnović, predstavnica Ministarstva unutarnjih poslova, članica
- Branko Hrg, predstavnik Ministarstva obrane, član
- Davor Huška, predstavnik Ministarstva regionalnog razvoja i fondova Europske unije, član
- Ante Deur, predstavnik Odbora za ratne veterane Hrvatskog sabora, član
- Vedran Los, predstavnik Grada Daruvara, član
- Joso Grahovac, predstavnik Grada Petrinje, član
- Paško Rakić, predstavnik Grada Šibenika, član
- Krešimir Ivančić, predstavnik udruga iz Domovinskog rata s područja Daruvara, član
- Antun Pintar, predstavnik udruga iz Domovinskog rata s područja Petrinje, član
- Željko Tadić, predstavnik udruga iz Domovinskog rata s područja Sinja, član
- Dragan Rak, predstavnik udruga iz Domovinskog rata s područja Šibenika, član
